Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GJA9P57773 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJA9P57773 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GJA9P57773 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GJA9P57773 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GJA9P57773 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GJA9P57773 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GJA9P57773 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GJA9P57773 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GJA9P57773 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GJA9P57773 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA9P57773 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA9P57773 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA9P57773 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA9P57773 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA9P57773 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GJA9P57773 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GJA9P57773 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms