Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
AP1S2P56377 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
AP1S2P56377 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms