Protein–RNA interactions for Protein: P55822

SH3BGR, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRP55822 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SH3BGRP55822 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BGRP55822 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BGRP55822 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.33■■□□□ 1
SH3BGRP55822 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BGRP55822 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SH3BGRP55822 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SH3BGRP55822 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRP55822 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRP55822 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRP55822 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRP55822 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRP55822 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SH3BGRP55822 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SH3BGRP55822 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SH3BGRP55822 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms