Protein–RNA interactions for Protein: P55087

AQP4, Aquaporin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP4P55087 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AQP4P55087 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AQP4P55087 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AQP4P55087 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AQP4P55087 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
AQP4P55087 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
AQP4P55087 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AQP4P55087 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AQP4P55087 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AQP4P55087 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
AQP4P55087 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AQP4P55087 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
AQP4P55087 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
AQP4P55087 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
AQP4P55087 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AQP4P55087 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AQP4P55087 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
AQP4P55087 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
AQP4P55087 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
AQP4P55087 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AQP4P55087 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AQP4P55087 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AQP4P55087 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
AQP4P55087 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AQP4P55087 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AQP4P55087 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
AQP4P55087 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
AQP4P55087 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms