Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CACNB3P54284 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACNB3P54284 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACNB3P54284 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms