Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
POLR2KP53803 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC16■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
POLR2KP53803 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
POLR2KP53803 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms