Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC5A3P53794 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC5A3P53794 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms