Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGDP52209 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGDP52209 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGDP52209 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGDP52209 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGDP52209 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGDP52209 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGDP52209 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGDP52209 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGDP52209 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGDP52209 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGDP52209 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGDP52209 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGDP52209 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGDP52209 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGDP52209 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGDP52209 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGDP52209 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGDP52209 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGDP52209 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGDP52209 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGDP52209 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGDP52209 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGDP52209 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGDP52209 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PGDP52209 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGDP52209 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGDP52209 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PGDP52209 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGDP52209 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGDP52209 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGDP52209 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PGDP52209 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGDP52209 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PGDP52209 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGDP52209 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGDP52209 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PGDP52209 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PGDP52209 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PGDP52209 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms