Protein–RNA interactions for Protein: P51801

CLCNKB, Chloride channel protein ClC-Kb, humanhuman

Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCNKBP51801 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLCNKBP51801 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLCNKBP51801 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CLCNKBP51801 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms