Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRE11P49959 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MRE11P49959 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRE11P49959 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRE11P49959 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRE11P49959 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRE11P49959 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRE11P49959 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MRE11P49959 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRE11P49959 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRE11P49959 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRE11P49959 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRE11P49959 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRE11P49959 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRE11P49959 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRE11P49959 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MRE11P49959 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MRE11P49959 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MRE11P49959 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MRE11P49959 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MRE11P49959 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRE11P49959 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRE11P49959 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRE11P49959 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRE11P49959 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRE11P49959 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRE11P49959 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MRE11P49959 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MRE11P49959 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MRE11P49959 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRE11P49959 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRE11P49959 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MRE11P49959 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms