Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FNTAP49354 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FNTAP49354 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNTAP49354 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNTAP49354 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNTAP49354 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FNTAP49354 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTAP49354 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTAP49354 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTAP49354 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FNTAP49354 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNTAP49354 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNTAP49354 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNTAP49354 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FNTAP49354 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FNTAP49354 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FNTAP49354 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTAP49354 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTAP49354 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTAP49354 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTAP49354 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTAP49354 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTAP49354 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FNTAP49354 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTAP49354 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTAP49354 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTAP49354 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTAP49354 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTAP49354 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTAP49354 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FNTAP49354 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNTAP49354 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNTAP49354 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNTAP49354 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNTAP49354 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FNTAP49354 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FNTAP49354 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FNTAP49354 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms