Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TGM4P49221 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TGM4P49221 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM4P49221 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM4P49221 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM4P49221 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM4P49221 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TGM4P49221 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TGM4P49221 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TGM4P49221 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TGM4P49221 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TGM4P49221 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TGM4P49221 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TGM4P49221 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms