Protein–RNA interactions for Protein: P49019

HCAR3, Hydroxycarboxylic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCAR3P49019 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCAR3P49019 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HCAR3P49019 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HCAR3P49019 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HCAR3P49019 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms