Protein–RNA interactions for Protein: P48736

PIK3CG, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit gamma isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CGP48736 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
PIK3CGP48736 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PIK3CGP48736 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PIK3CGP48736 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms