Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC39.83■■■■□ 3.97
NESP48681 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC39.83■■■■□ 3.97
NESP48681 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
NESP48681 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
NESP48681 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC39.82■■■■□ 3.96
NESP48681 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC39.82■■■■□ 3.96
NESP48681 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC39.82■■■■□ 3.96
NESP48681 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NESP48681 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NESP48681 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NESP48681 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC39.81■■■■□ 3.96
NESP48681 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
NESP48681 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NESP48681 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
NESP48681 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC39.8■■■■□ 3.96
NESP48681 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
NESP48681 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NESP48681 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NESP48681 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NESP48681 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NESP48681 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
NESP48681 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
NESP48681 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC39.77■■■■□ 3.96
NESP48681 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NESP48681 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC39.76■■■■□ 3.96
NESP48681 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NESP48681 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
NESP48681 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.76■■■■□ 3.96
NESP48681 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.95
NESP48681 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.95
NESP48681 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NESP48681 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NESP48681 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NESP48681 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
NESP48681 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NESP48681 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC39.75■■■■□ 3.95
NESP48681 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC39.75■■■■□ 3.95
NESP48681 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NESP48681 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NESP48681 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NESP48681 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
NESP48681 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.73■■■■□ 3.95
NESP48681 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NESP48681 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NESP48681 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NESP48681 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NESP48681 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
NESP48681 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.72■■■■□ 3.95
NESP48681 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC39.72■■■■□ 3.95
NESP48681 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC39.71■■■■□ 3.95
NESP48681 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NESP48681 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC39.71■■■■□ 3.95
NESP48681 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
NESP48681 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NESP48681 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NESP48681 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NESP48681 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NESP48681 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
NESP48681 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC39.68■■■■□ 3.94
NESP48681 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NESP48681 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NESP48681 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NESP48681 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
NESP48681 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC39.68■■■■□ 3.94
NESP48681 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.67■■■■□ 3.94
NESP48681 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NESP48681 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC39.67■■■■□ 3.94
NESP48681 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
NESP48681 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NESP48681 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.66■■■■□ 3.94
NESP48681 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NESP48681 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC39.66■■■■□ 3.94
NESP48681 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
NESP48681 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NESP48681 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NESP48681 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NESP48681 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC39.65■■■■□ 3.94
NESP48681 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC39.65■■■■□ 3.94
NESP48681 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.65■■■■□ 3.94
NESP48681 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC39.64■■■■□ 3.94
NESP48681 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NESP48681 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NESP48681 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
NESP48681 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.64■■■■□ 3.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms