Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PTDSS1P48651 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PTDSS1P48651 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms