Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LSSP48449 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LSSP48449 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LSSP48449 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LSSP48449 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSSP48449 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSSP48449 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSSP48449 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSSP48449 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
LSSP48449 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSSP48449 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LSSP48449 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSSP48449 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LSSP48449 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LSSP48449 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSSP48449 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSSP48449 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSSP48449 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LSSP48449 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSSP48449 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSSP48449 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSSP48449 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSSP48449 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSSP48449 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSSP48449 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LSSP48449 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
LSSP48449 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
LSSP48449 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
LSSP48449 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSSP48449 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSSP48449 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
LSSP48449 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSSP48449 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSSP48449 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSSP48449 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSSP48449 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
LSSP48449 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
LSSP48449 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
LSSP48449 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms