Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PIP4K2AP48426 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PIP4K2AP48426 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PIP4K2AP48426 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms