Protein–RNA interactions for Protein: P47211

GALR1, Galanin receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GALR1P47211 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GALR1P47211 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GALR1P47211 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GALR1P47211 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GALR1P47211 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GALR1P47211 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GALR1P47211 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GALR1P47211 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GALR1P47211 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GALR1P47211 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GALR1P47211 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALR1P47211 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALR1P47211 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALR1P47211 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALR1P47211 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALR1P47211 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALR1P47211 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALR1P47211 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GALR1P47211 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALR1P47211 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALR1P47211 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALR1P47211 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GALR1P47211 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GALR1P47211 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GALR1P47211 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms