Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSFP46459 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSFP46459 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSFP46459 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSFP46459 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSFP46459 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSFP46459 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSFP46459 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSFP46459 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSFP46459 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NSFP46459 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSFP46459 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSFP46459 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSFP46459 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSFP46459 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSFP46459 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSFP46459 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSFP46459 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSFP46459 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSFP46459 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSFP46459 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSFP46459 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NSFP46459 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSFP46459 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms