Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RPL35P42766 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RPL35P42766 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL35P42766 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL35P42766 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL35P42766 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL35P42766 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL35P42766 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL35P42766 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RPL35P42766 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RPL35P42766 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RPL35P42766 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL35P42766 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL35P42766 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms