Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP8P40818 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP8P40818 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP8P40818 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP8P40818 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP8P40818 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP8P40818 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP8P40818 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
USP8P40818 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
USP8P40818 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP8P40818 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP8P40818 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP8P40818 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP8P40818 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP8P40818 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP8P40818 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP8P40818 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP8P40818 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP8P40818 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP8P40818 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP8P40818 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP8P40818 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP8P40818 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP8P40818 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms