Protein–RNA interactions for Protein: P39086

GRIK1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK1P39086 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GRIK1P39086 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GRIK1P39086 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GRIK1P39086 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms