Protein–RNA interactions for Protein: P38935

IGHMBP2, DNA-binding protein SMUBP-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHMBP2P38935 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IGHMBP2P38935 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IGHMBP2P38935 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IGHMBP2P38935 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms