Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGP37231 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PPARGP37231 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PPARGP37231 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGP37231 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGP37231 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGP37231 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGP37231 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGP37231 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PPARGP37231 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PPARGP37231 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGP37231 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGP37231 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGP37231 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGP37231 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGP37231 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGP37231 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGP37231 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PPARGP37231 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PPARGP37231 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGP37231 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGP37231 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGP37231 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGP37231 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGP37231 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGP37231 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGP37231 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PPARGP37231 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PPARGP37231 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PPARGP37231 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PPARGP37231 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGP37231 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGP37231 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGP37231 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGP37231 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGP37231 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGP37231 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGP37231 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PPARGP37231 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PPARGP37231 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms