Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TGFBR1P36897 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TGFBR1P36897 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms