Protein–RNA interactions for Protein: P36578

RPL4, 60S ribosomal protein L4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL4P36578 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL4P36578 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
RPL4P36578 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL4P36578 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL4P36578 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RPL4P36578 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL4P36578 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL4P36578 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL4P36578 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RPL4P36578 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RPL4P36578 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RPL4P36578 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms