Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ATP5C1P36542 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP5C1P36542 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms