Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KRT9P35527 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT9P35527 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT9P35527 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT9P35527 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KRT9P35527 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KRT9P35527 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRT9P35527 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KRT9P35527 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT9P35527 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT9P35527 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT9P35527 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
KRT9P35527 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KRT9P35527 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KRT9P35527 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KRT9P35527 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT9P35527 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT9P35527 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT9P35527 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT9P35527 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT9P35527 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KRT9P35527 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT9P35527 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KRT9P35527 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.1 ms