Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RFC1P35251 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RFC1P35251 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFC1P35251 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFC1P35251 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFC1P35251 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFC1P35251 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RFC1P35251 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RFC1P35251 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFC1P35251 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFC1P35251 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFC1P35251 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFC1P35251 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RFC1P35251 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RFC1P35251 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFC1P35251 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFC1P35251 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFC1P35251 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RFC1P35251 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFC1P35251 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFC1P35251 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFC1P35251 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RFC1P35251 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RFC1P35251 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFC1P35251 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RFC1P35251 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFC1P35251 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFC1P35251 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFC1P35251 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFC1P35251 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFC1P35251 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RFC1P35251 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RFC1P35251 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
RFC1P35251 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RFC1P35251 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RFC1P35251 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms