Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNA3P32297 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CHRNA3P32297 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CHRNA3P32297 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms