Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
APOBEC3AP31941 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBEC3AP31941 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms