Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GABRA5P31644 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GABRA5P31644 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms