Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CASQ1P31415 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CASQ1P31415 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
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