Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC133552.4-201ENST00000576103 676 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 LINC01513-201ENST00000416930 483 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HOXD11P31277 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AL357507.1-201ENST00000435946 669 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC019227.1-201ENST00000526902 510 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AL513283.1-201ENST00000441790 1087 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC025423.2-201ENST00000537570 439 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HOXD11P31277 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HOXD11P31277 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms