Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HLA-DMAP28067 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HLA-DMAP28067 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
HLA-DMAP28067 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms