Protein–RNA interactions for Protein: P27816

MAP4, Microtubule-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4P27816 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4P27816 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4P27816 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4P27816 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP4P27816 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP4P27816 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4P27816 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4P27816 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4P27816 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP4P27816 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP4P27816 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP4P27816 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP4P27816 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP4P27816 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP4P27816 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP4P27816 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms