Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DNMT1P26358 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
DNMT1P26358 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DNMT1P26358 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms