Protein–RNA interactions for Protein: P26045

PTPN3, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3P26045 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTPN3P26045 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPN3P26045 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPN3P26045 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms