Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
ITGA3P26006 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ITGA3P26006 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms