Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PTPRDP23468 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PTPRDP23468 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
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