Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
GCSHP23434 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCSHP23434 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCSHP23434 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCSHP23434 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCSHP23434 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms