Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
HRCP23327 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HRCP23327 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HRCP23327 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HRCP23327 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HRCP23327 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HRCP23327 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
HRCP23327 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
HRCP23327 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
HRCP23327 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
HRCP23327 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HRCP23327 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HRCP23327 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HRCP23327 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HRCP23327 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HRCP23327 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
HRCP23327 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
HRCP23327 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HRCP23327 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HRCP23327 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HRCP23327 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HRCP23327 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
HRCP23327 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HRCP23327 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
HRCP23327 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
HRCP23327 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
HRCP23327 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
HRCP23327 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
HRCP23327 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HRCP23327 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HRCP23327 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
HRCP23327 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
HRCP23327 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HRCP23327 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HRCP23327 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
HRCP23327 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
HRCP23327 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HRCP23327 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
HRCP23327 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
HRCP23327 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
HRCP23327 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
HRCP23327 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
HRCP23327 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HRCP23327 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HRCP23327 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HRCP23327 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HRCP23327 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HRCP23327 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
HRCP23327 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
HRCP23327 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
HRCP23327 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HRCP23327 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
HRCP23327 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HRCP23327 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HRCP23327 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
HRCP23327 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
HRCP23327 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HRCP23327 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HRCP23327 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HRCP23327 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HRCP23327 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HRCP23327 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HRCP23327 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
HRCP23327 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
HRCP23327 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HRCP23327 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HRCP23327 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
HRCP23327 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
HRCP23327 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms