Protein–RNA interactions for Protein: P21941

MATN1, Cartilage matrix protein, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MATN1P21941 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN1P21941 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN1P21941 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN1P21941 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN1P21941 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN1P21941 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN1P21941 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MATN1P21941 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MATN1P21941 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MATN1P21941 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MATN1P21941 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MATN1P21941 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MATN1P21941 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MATN1P21941 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MATN1P21941 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MATN1P21941 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MATN1P21941 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MATN1P21941 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MATN1P21941 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MATN1P21941 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MATN1P21941 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MATN1P21941 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MATN1P21941 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MATN1P21941 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MATN1P21941 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MATN1P21941 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MATN1P21941 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MATN1P21941 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MATN1P21941 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MATN1P21941 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MATN1P21941 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms