Protein–RNA interactions for Protein: P21695

GPD1, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase [NAD(+)], cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD1P21695 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GPD1P21695 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD1P21695 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD1P21695 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD1P21695 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD1P21695 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD1P21695 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD1P21695 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD1P21695 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPD1P21695 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD1P21695 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD1P21695 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD1P21695 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD1P21695 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPD1P21695 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPD1P21695 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD1P21695 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD1P21695 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD1P21695 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD1P21695 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD1P21695 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPD1P21695 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPD1P21695 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPD1P21695 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPD1P21695 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPD1P21695 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD1P21695 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD1P21695 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD1P21695 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD1P21695 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD1P21695 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD1P21695 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD1P21695 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPD1P21695 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GPD1P21695 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPD1P21695 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GPD1P21695 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms