Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CAPN3P20807 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CAPN3P20807 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CAPN3P20807 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms