Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LMNB1P20700 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LMNB1P20700 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LMNB1P20700 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms