Protein–RNA interactions for Protein: P19878

NCF2, Neutrophil cytosol factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF2P19878 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCF2P19878 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCF2P19878 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCF2P19878 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF2P19878 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF2P19878 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF2P19878 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF2P19878 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF2P19878 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCF2P19878 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCF2P19878 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCF2P19878 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCF2P19878 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCF2P19878 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF2P19878 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF2P19878 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF2P19878 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF2P19878 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF2P19878 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF2P19878 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF2P19878 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCF2P19878 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCF2P19878 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NCF2P19878 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NCF2P19878 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCF2P19878 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NCF2P19878 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms