Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2CP19387 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
POLR2CP19387 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms