Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HDCP19113 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDCP19113 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDCP19113 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDCP19113 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDCP19113 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDCP19113 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDCP19113 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HDCP19113 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HDCP19113 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HDCP19113 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDCP19113 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDCP19113 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HDCP19113 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDCP19113 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDCP19113 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDCP19113 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDCP19113 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HDCP19113 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HDCP19113 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDCP19113 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDCP19113 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDCP19113 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDCP19113 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDCP19113 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDCP19113 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDCP19113 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HDCP19113 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HDCP19113 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDCP19113 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDCP19113 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDCP19113 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDCP19113 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDCP19113 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HDCP19113 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDCP19113 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDCP19113 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDCP19113 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDCP19113 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDCP19113 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDCP19113 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HDCP19113 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
HDCP19113 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HDCP19113 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDCP19113 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HDCP19113 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDCP19113 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDCP19113 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDCP19113 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDCP19113 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDCP19113 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HDCP19113 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDCP19113 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDCP19113 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HDCP19113 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDCP19113 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDCP19113 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDCP19113 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HDCP19113 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms